El primer paso es la desinfección de los lagos o vallados con la aplicaciones de productos desinfectantes para eliminar los microorganismos indeseados. El segundo es la intervención con microorganismos benéficos para el tratamiento de la materia orgánica presente en el lago. Igualmente los microorganismos se encargan de los nitritos, nitratos, fosforo y otros componentes que en interacción con la luz solar son los generadores de las algas.
